Достаточно выложить два / три примера сообщения об ошибках.
НЕ выкладывайте всю "простыню" логов! Поверьте, это лишь замедлит ответ на Ваш вопрос.

• Какую АТС используете?
• Кто производит настройку АТС?
• По каким инструкциям настраивали АТС для интеграции с 1С?
• Какую версию панели телефонии используете?
• Установлен ли драйвер защиты?
  

Ясно. Вероятно настройка АТС не завершена.
Проверьте выполнение инструкций по ручной настройке.

Пожалуйста))

По какой инструкции настраивали АТС?

Описание функции доступно по ссылке. Функцию поддерживают
Марки аппаратных телефонов:

• Linksys
• Cisco
• Yealink
• Aastra
• Snom
• Polycom
  

Программные телефоны

• SIP софтфон для 1С
• Telephone-PT1C
• Jitsi
• microsip
  

Отлично. 2.0.14.1 стабильный релиз.

Скорее всего восстановили настройке из старой станции.
пробуйте выполнить инструкции по переходу.

На версию 3.0 сразу перешли? или апгрейд производили с более ранних, 2.х версий?

Перейдите по этой ссылке.
Что отображается?
(может потребоваться в контекстном меню окна выполнить действие "показать исходный код странцы")

Запустите панель телефонии под пользователем "Администратор". Настройте под ним.
Или раз в отладку полезли - закоментируйте  инициализацию SIP.

Нет, не так. Звуковые устройства локального ПК, должны быть подключены к удаленному серверу терминалов - "проброшены".
То есть софтфон должен работать с звуковыми устройствами удаленного устройства.

Если звуковых устройств нет - то работа софтфона (любого) не возможна.

Ознакомьтесь с документацией:

1. Встраивание в конфигурацию 1C
2. Настройка в режиме 1C:Предприятие 8
3. Инструкции для версии 1.2.21.1.
   

• Воспользуйтесь советом, который дан в ответе выше.
• Встройте панель телефонии в конфигурацию.
• Назначьте пользователям внутренние номера в настройках панели, вкладка "Пользователи панели"
  

Без интеграции пробовали запускать обработку?

Приложите снимок экрана "Справка" - "О программе".